MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Korea 1168P

Total Repeats: 102005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020245	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449061976
2	NC_020245	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061976
3	NC_020245	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061976
4	NC_020245	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061976
5	NC_020245	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061976
6	NC_020245	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061976
7	NC_020245	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061976
8	NC_020245	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061976
9	NC_020245	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	449061976
10	NC_020245	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061976
11	NC_020245	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061976
12	NC_020245	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061976
13	NC_020245	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449061976
14	NC_020245	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	449061976
15	NC_020245	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061976
16	NC_020245	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	449061976
17	NC_020245	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	449061976
18	NC_020245	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	449061976
19	NC_020245	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061976
20	NC_020245	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061976
21	NC_020245	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449061976
22	NC_020245	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449061976
23	NC_020245	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	449061976
24	NC_020245	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	449061976
25	NC_020245	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061976
26	NC_020245	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449061976
27	NC_020245	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061976
28	NC_020245	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061976
29	NC_020245	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	449061976
30	NC_020245	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061976
31	NC_020245	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061976
32	NC_020245	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	449061976
33	NC_020245	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449061976
34	NC_020245	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	449061977
35	NC_020245	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	449061977
36	NC_020245	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	449061977
37	NC_020245	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	449061977
38	NC_020245	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061977
39	NC_020245	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061977
40	NC_020245	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061977
41	NC_020245	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061977
42	NC_020245	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061977
43	NC_020245	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	449061977
44	NC_020245	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	449061977
45	NC_020245	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061977
46	NC_020245	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061977
47	NC_020245	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061977
48	NC_020245	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061977
49	NC_020245	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061977
50	NC_020245	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061977
51	NC_020245	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	449061977
52	NC_020245	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061977
53	NC_020245	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	449061977
54	NC_020245	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	449061977
55	NC_020245	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449061977
56	NC_020245	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	449061977
57	NC_020245	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449061977
58	NC_020245	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061977
59	NC_020245	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	449061977
60	NC_020245	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	449061977
61	NC_020245	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061977
62	NC_020245	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	449061977
63	NC_020245	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	449061978
64	NC_020245	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061978
65	NC_020245	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061978
66	NC_020245	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	449061978
67	NC_020245	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061978
68	NC_020245	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061978
69	NC_020245	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449061978
70	NC_020245	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449061978
71	NC_020245	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061978
72	NC_020245	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	449061978
73	NC_020245	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061978
74	NC_020245	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449061978
75	NC_020245	GTG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061978
76	NC_020245	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	449061978
77	NC_020245	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061978
78	NC_020245	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	449061978
79	NC_020245	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449061978
80	NC_020245	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061978
81	NC_020245	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061978
82	NC_020245	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061978
83	NC_020245	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061978
84	NC_020245	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061978
85	NC_020245	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061978
86	NC_020245	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061978
87	NC_020245	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061978
88	NC_020245	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061978
89	NC_020245	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061978
90	NC_020245	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061978
91	NC_020245	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061978
92	NC_020245	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061979
93	NC_020245	CG	5	10	4542	4551	0 %	0 %	50 %	50 %	449061979
94	NC_020245	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	449061979
95	NC_020245	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061979
96	NC_020245	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061979
97	NC_020245	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449061979
98	NC_020245	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061979
99	NC_020245	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061979
100	NC_020245	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061979
101	NC_020245	CG	3	6	4978	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	449061979
102	NC_020245	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449061980
103	NC_020245	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061980
104	NC_020245	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061980
105	NC_020245	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449061980
106	NC_020245	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449061980
107	NC_020245	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061980
108	NC_020245	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061980
109	NC_020245	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061980
110	NC_020245	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061980
111	NC_020245	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	449061980
112	NC_020245	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	449061980
113	NC_020245	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061980
114	NC_020245	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061980
115	NC_020245	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061980
116	NC_020245	CGGCGT	2	12	5602	5613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	449061980
117	NC_020245	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061980
118	NC_020245	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	449061980
119	NC_020245	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449061980
120	NC_020245	ACGGT	2	10	5747	5756	20 %	20 %	40 %	20 %	449061980
121	NC_020245	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	449061980
122	NC_020245	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449061980
123	NC_020245	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061980
124	NC_020245	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061980
125	NC_020245	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061980
126	NC_020245	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061980
127	NC_020245	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061980
128	NC_020245	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	449061980
129	NC_020245	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061980
130	NC_020245	AAGGAC	2	12	6254	6265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	449061980
131	NC_020245	AGACCA	2	12	6348	6359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	449061980
132	NC_020245	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061980
133	NC_020245	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	449061980
134	NC_020245	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449061980
135	NC_020245	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	449061980
136	NC_020245	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449061980
137	NC_020245	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061980
138	NC_020245	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061980
139	NC_020245	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061980
140	NC_020245	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061980
141	NC_020245	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061980
142	NC_020245	GAA	2	6	7033	7038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	449061980
143	NC_020245	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449061980
144	NC_020245	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449061980
145	NC_020245	GT	3	6	7131	7136	0 %	50 %	50 %	0 %	449061980
146	NC_020245	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061980
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148	NC_020245	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061980
149	NC_020245	CG	3	6	7210	7215	0 %	0 %	50 %	50 %	449061980
150	NC_020245	GACA	2	8	7304	7311	50 %	0 %	25 %	25 %	449061981
151	NC_020245	GCC	2	6	7319	7324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061981
152	NC_020245	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061981
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157	NC_020245	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	449061981
158	NC_020245	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449061981
159	NC_020245	TGG	2	6	7627	7632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061981
160	NC_020245	CGG	2	6	7672	7677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061981
161	NC_020245	CGA	2	6	7736	7741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061981
162	NC_020245	ACG	2	6	7768	7773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061981
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165	NC_020245	CGC	2	6	7870	7875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061981
166	NC_020245	ACG	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061981
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169	NC_020245	TCG	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061981
170	NC_020245	GTT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	449061981
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175	NC_020245	TCG	2	6	8344	8349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061981
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186	NC_020245	CGA	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061981
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211	NC_020245	CGA	3	9	9605	9613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061981
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253	NC_020245	GGC	2	6	12108	12113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061985
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255	NC_020245	GAG	2	6	12210	12215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	449061985
256	NC_020245	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	449061985
257	NC_020245	ACG	2	6	12664	12669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061986
258	NC_020245	CGG	2	6	12737	12742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061986
259	NC_020245	CGA	2	6	12761	12766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061986
260	NC_020245	TCA	2	6	12850	12855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449061986
261	NC_020245	GGT	2	6	12986	12991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061986
262	NC_020245	TCG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061987
263	NC_020245	CAG	2	6	13223	13228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	449061988
264	NC_020245	GGC	2	6	13266	13271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061988
265	NC_020245	TCG	2	6	13286	13291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061988
266	NC_020245	GAT	2	6	13297	13302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449061988
267	NC_020245	AACC	2	8	13337	13344	50 %	0 %	0 %	50 %	449061988
268	NC_020245	GC	3	6	13388	13393	0 %	0 %	50 %	50 %	449061988
269	NC_020245	CCCG	2	8	13446	13453	0 %	0 %	25 %	75 %	449061988
270	NC_020245	TGC	2	6	13550	13555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061988
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278	NC_020245	GGCGT	2	10	14153	14162	0 %	20 %	60 %	20 %	449061990
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284	NC_020245	ACC	2	6	14328	14333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449061990
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286	NC_020245	GCG	2	6	14387	14392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061990
287	NC_020245	CCG	2	6	14395	14400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061990
288	NC_020245	GGC	2	6	14414	14419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061990
289	NC_020245	GGGCC	2	10	14436	14445	0 %	0 %	60 %	40 %	449061990
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292	NC_020245	CAT	2	6	14603	14608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449061990
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295	NC_020245	CGC	2	6	14684	14689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061990
296	NC_020245	CGC	3	9	14699	14707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061990
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299	NC_020245	ACT	2	6	14869	14874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449061990
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301	NC_020245	ACC	2	6	15013	15018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449061991
302	NC_020245	GCC	2	6	15033	15038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061991
303	NC_020245	GC	3	6	15092	15097	0 %	0 %	50 %	50 %	449061991
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371	NC_020245	CTGG	2	8	17907	17914	0 %	25 %	50 %	25 %	449061993
372	NC_020245	CGG	2	6	17926	17931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	449061993
373	NC_020245	GC	3	6	17935	17940	0 %	0 %	50 %	50 %	449061993
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381	NC_020245	GGT	2	6	18567	18572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	449061993
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385	NC_020245	CCGC	2	8	18790	18797	0 %	0 %	25 %	75 %	449061994
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389	NC_020245	TTAGC	2	10	19036	19045	20 %	40 %	20 %	20 %	449061994
390	NC_020245	CG	3	6	19064	19069	0 %	0 %	50 %	50 %	449061994
391	NC_020245	GCT	2	6	19072	19077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	449061994
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393	NC_020245	GGTCC	2	10	19108	19117	0 %	20 %	40 %	40 %	449061994
394	NC_020245	GCC	2	6	19154	19159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	449061994
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495	NC_020245	CG	3	6	23513	23518	0 %	0 %	50 %	50 %	449061997
496	NC_020245	CAC	2	6	23539	23544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	449061997
497	NC_020245	CG	3	6	23573	23578	0 %	0 %	50 %	50 %	449061997
498	NC_020245	CAT	2	6	23614	23619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	449061997
499	NC_020245	CAA	2	6	23686	23691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	449061997
500	NC_020245	GAT	2	6	23875	23880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	449061998

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